Las exposiciones permanentes del Museo de la Medicina Mexicana permiten interactuar con las piezas de manera didáctica y participativa, y a la vez generar cuestionamientos que conduzcan a la comprensión de la medicina mexicana y del patrimonio artístico universitario. El palacio, a su vez, ofrece exposiciones temporales que complementan los contenidos temáticos de las salas, y diversos programas que buscan insertar activamente al público como el sistema de voluntariado y servicios sociales.
Además de exposiciones el Palacio de la Escuela Medicina, ofrece visitas guiadas, talleres para niños, cursos, diplomados, conciertos, eventos culturales.